Da die optionale Passphrase direkt beim Entsperren der BitBox02 mit dem normalen Seed (deine 24 Wörter) verquirlt wird, ist es richtig, dass Du die BitBox02 dafür abziehen und neu entsprerren musst.
Wenn’s eher um die separate Verwaltung von Coins geht, sind die neuen Konten eventuell besser geeignet. Da hast Du immer direkten Zugriff auf die verschiedenen Töpfchen: